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智慧財產憑證分為憑證IC卡與軟體憑證2種，比較如下：
憑證IC卡 （憑證儲存於IC卡）
軟體憑證（憑證以電子檔案單獨存在）
安全性
IC卡保護，安全性最高
使用者自行保管、管理
密碼防護
有Pin code密碼防護
便利性
使用者不能複製、多人共用
使用者可以複製、共用
費用
需繳交＄500購買憑證IC卡
不需繳交費用
使用者可依據自己的需求選擇憑證種類。
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